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NIH:1450万美元资助新一代基因测序技术研究
作者: 来源: 2014-08-07

  

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  美国国立卫生研究院(NIH)近日宣布,它将向开发新型测序技术的8支研究团队资助1450万美元。NIH将利用这些资金支持多种技术,包括纳米孔测序技术和微流体技术,资助时间为两年到四年。

  这一资助属于国家人类基因组研究所(NHGRI)的先进DNA测序技术项目(Advanced DNA Sequencing Technology program)的一部分,它在2004年启动,目标是降低测序成本。

  NHGRI基因组技术项目主管Jeffery Schloss表示:“尽管以1000美元测序基因组的目标已接近,但关于控制成本和实现高质量的DNA测序数据,仍然存在许多挑战。”

  大部分的资助被五所大学的研究人员获得。斯克里普斯研究所将在三年内获得440万美元。这个团队将由M. Reza Ghadiri领导,目标是开发蛋白纳米孔芯片,以便平行测序数万个DNA分子,而最终目标是在10分钟内测序人类基因组。

  加州大学圣地亚哥分校(UCSD)将在四年内获得370万美元的资助。这个团队由Kun Zhang博士和Xiaohua Huang博士领导,将开发一种利用微流体的系统,实现单个哺乳动物细胞的基因组测序。

  加州大学圣克鲁兹分校将在三年内获得229万美元的资助。首席研究员Mark Akeson领导的团队计划开发纳米孔设备对单个DNA分子进行测序。此设备中包含一个传感器,可触碰、检查和鉴定DNA链中的每个核苷酸。

  华盛顿大学将在三年内获得170万美元。首席研究员Jay Shendure博士及其同事计划开发新的分子生物学技术,以便经济高效地拼接远距离的基因组。

  宾夕法尼亚大学将在两年内获得88万美元的资助。Marija Drndic博士将领导研究人员开发石墨烯纳米孔,其目标是实现单个DNA碱基的检测,而不需要在DNA穿过纳米孔时减慢其速度。

  另外还有三家公司获得了NIH的资助。Illumina将在两年内获得59.2万美元。首席研究员Boyan Boyanov及其同事将开发一种杂合蛋白固态纳米孔芯片系统,让科学家开展大规模的DNA测序。他们的目标是将计算机芯片的制造方法与生物纳米孔相结合,以改善纳米孔平台的稳健性。

  同时获得资助的还有Caerus分子诊断公司,它正在开发一种单分子测序技术。该研究团队由Javier Farinas领导,计划利用一种经过改造的酶将单分子DNA测序反应的产物转化成多个拷贝的报告分子。这家公司将在三年内获得70.1万美元。

  Eve Biomedical公司也将在两年内获得50万美元的资助。Theofilos Kotseroglou博士及其同事将研究一个系统,利用碳纳米管上的聚合酶对DNA测序。