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Life Tech、达安启动Proton临床试验预计年底CFDA获批
作者: 来源: 2014-06-06

  导读:Life Technologies现与达安基因合作申报Ion Proton测序仪的CFDA认证。Ion Proton是Life最新一代测序平台,提供了全新设计的芯片加载机制为IonProton芯片和IonProton测序仪提供了最佳的界面,并且工作流程极为简单且易操作。

  Life Technologies现与达安基因合作申报Ion Proton测序仪的CFDA认证。Ion Proton是Life最新一代测序平台,提供了全新设计的芯片加载机制为IonProton芯片和IonProton测序仪提供了最佳的界面,并且工作流程极为简单且易操作。现正在临床试验中,预计年底可以获批。

  Ion Proton是公司新一代测序平台,和竞争对手illumina公司的同类产品HiSeq相比更适用于临床。Hiseq开机样本至少需要150-200个,而Ion Ptoton只需10个样本就可开机,方便医疗机构开展筛查业务;在售价上,Ion Proton单台售价40-50万美元,而HiSeq单价约60-70万美元。这台仪器获批后将主要用于无创产前筛查的临床应用。

  Ion Proton测序仪

  Life Technologies公司新一代Ion Proton测序仪将最先推出的是Ion Proton I芯片,适合外显子组测序。而在今年底或明年初,Life Tech将继续推出Ion Proton II芯片,用于全基因组测序。

  AudreyPapp讲解Ion PGM测序仪和Ion Proton测序仪使用经历

  一、性能介绍

  单芯片载入中

  为实现优化的性能和简便性,IonProton™系统提供了全新设计的芯片加载机制。新型的垂直芯片夹简单易用,为IonProton™芯片和IonProton™测序仪提供了最佳的界面。IonProton™芯片只能朝一个方向插入,可实现防错加载,只需推动控制杆即可轻松活动芯片夹。

  集成的试剂输送

  IonProton™测序仪将所有试剂置于仪器前方的单扇门之后,十分方便。订购时,单个部件代号包括需要的全部试剂,容器被直接从一体化试剂盒装载至仪器上,操作简便、省时。其设计不仅简洁、美观,而且最大程度缩小了仪器的尺寸。

  二、工作流程

  IonProton™系统提供了简单的端到端工作流程,可快速获得高质量的测序结果

  IonTorrent备受期待的IonProton™系统*可使外显子组、全转录组和人类基因组规模的测序变得前所未有的方便、经济。

  IonPI™芯片适用于外显子组和转录组测序,是简单、全面的工作流程——从文库制备到数据分析——的一部分。

  IonPII™芯片可用于人类基因组规模的测序,预计将于IonProton™系统推出后约6个月问世。

  IonProton™系统工作流程包括优化的文库试剂盒、自动化模板制备、快速测序运行和集成数据分析解决方案。

  1 文库构造

  Ion文库试剂盒提供了简单的高性能文库解决方案,与Ion半导体测序系统结合使用,可用于外显子组、转录组、基因组和靶点测序。

  2 模板制备

  IonChef™系统*†将为各种专业知识的用户提供高通量的自动化模板制备和芯片加载。较低通量的用户可选择现已有售的IonOneTouch™2系统,实现全自动模板制备。

  3 运行测序

  Proton™Torrent服务器预加载了TorrentSuite软件,可用于碱基检测、作图、校准和变异体检测。变异体可加载至IonReporter™软件中,用于生物学阐释和常见变异体的鉴定。

  4 分析数据

  测序分析获得的数据自动传至装有TorrentSuite软件的Proton™Torrent服务器。Torrent软件套装将原始的电压半导体测序数据处理为DNA碱基序列。

  Ion Proton Sequencer initial data and performance

  三、系统数据处理

  采用先进的硬件可实现一天基因组测序

  IonProton™系统是能够实现$1,000基因组的唯一测序平台*。它将是可在一天内提供人类基因组规模分析的第一台仪器系统,包括数据处理、碱基检测和变异体检测。

  Ion Chef系统,全自动化制备您的样本

  IonProton™系统采用半导体技术,可提供在几个小时内完成测序所需的速度,而且利用IonProton™测序仪中先进的电子设备,能够一天内在Proton™Torrent服务器——IonProton™系统附带的简单的台式服务器——上实现变异体检测。

  IonProton™测序仪采用了最新、最先进的计算硬件(图形处理器(GPU)和现场可编程门阵列(FPGA)技术),可在测序仪内部实现密集型计算数据处理。随后在Proton™Torrent服务器上进行计算密集程度较低的碱基检测和变异体检测。

  IonProton™系统将提供前所未有的速度和价格优势,可在台式测序仪和台式服务器上实现外显子组、转录组和人类基因组测序,而直到现在,完成这些操作仍需体积较大的测序仪和高端集群。

  四、优势

  新的IonProton™测序仪更上一层楼.凭借密度比IonPGM™测序仪高1000倍的芯片,IonProton™测序仪将使得全基因组测序对每个实验室都触手可及.

  新的IonProton™测序仪是基于新一代的半导体测序技术,此技术已让IonPGM™测序仪成为世界上销售最快的测序仪.新的高通量芯片将实现让IonProton™测序仪与IonPGM™测序仪相当的运行单日流程,来完成单个人类基因组的测序.

  IonProton™台式测序仪,适合于每个实验室,各种应用,各种预算。

  IonProton测序仪,快速、简捷、扩展,独一无二的台式基因组中心。